仓鼠的公母区别主要在外生殖器上。雄性仓鼠的阴茎比雌性长，而雌性仓鼠的生殖器开口比雄性小。此外，雌性仓鼠在腹部的两侧有乳头，而雄性没有。
另外，雌性仓鼠在发情期时，会出现阴道分泌物，而雄性没有。
因此，通过观察仓鼠的外部生殖器和乳头，以及观察是否有阴道分泌物，可以较为准确地分辨仓鼠的性别。
仓鼠的性别可以通过生殖器的差异来分辨，非常明显。公仓鼠有一个较长且狭长的生殖器，而母仓鼠的生殖器比较短且圆形。因此，只需要仔细观察仓鼠的生殖器就可以轻松地分辨它们的性别。值得注意的是，仓鼠在分娩前几周，乳头会因激素分泌的变化而突出，因此也可以通过观察乳头的数量来分辨母仓鼠与公仓鼠。
乳头，区分仓鼠公母可以看乳头，母仓鼠会长有明显的乳头。
公仓鼠没有乳头；肛门，公仓鼠肛门离生殖器距离远，母仓鼠肛门离生殖器距离近；生殖器，公仓鼠身上会长有睾丸，屁股矫健，母仓鼠不会有凸起的生殖器，只有一段小口。