首先要明白一个问题，测定人类基因组的全部DNA序列并不是测定了每个人的每条DNA的碱基序列，而是选取了一些全球科学家认为比较典型的人的DNA来测序。
既然这样，测定的时候主要是考虑每个基因在染色体的位置，等位基因中的某个基因的序列（等位基因中的其他基因序列可能只差几个碱基对）。
所以测序是测所有的基因，当然应该测22对常染色体中各一条加上两条性染色体，因为X和Y染色体的非同源全段有非等位基因，都需要测定。
同理，只要是有性别的生物测序都应该测常染色体的一半加上两条性染色体；而没有性别的生物如水稻、豌豆等等只需测一半即可。
因为基因中A→G，C→T这是配对，测一半就可以知道另一半